加强农田的保护管理，防止农田退化和水土流失等问题的发生，通过农田修复，恢复农田的肥力和生产能力。加大对农田流转和规模经营的政策支持力度，鼓励农民将零散的小块农田整合成较大的经营单元，提高农田的集约化经营水平。加强对农田的管理和监管，建立健全的农田管理制度和监测体系，推动农田利用的科学化、规范化和可持续发展。
农田耕作制度改革提高农田利用效益的关键措施可以包括以下几个方面：
1. 推行科学耕作技术。利用现代农业技术手段，推广科学耕作技术，包括合理施肥、科学选种、精确灌溉等，以提高农作物产量和质量。
2. 发展农田水利。加大对农田水利设施建设的投入力度，改善灌溉条件，确保农作物获得充足的水源，提高水利资源的利用效率。
3. 优化土地利用结构。根据不同地区的农田资源条件和市场需求，合理安排土地利用结构，调整农作物种植布局，提高土地的综合利用效益。
4. 引导农民多元经营。鼓励农民发展农田多元经营，如兼业兼种、兼业兼养等，通过增加农田产出的多样性，提高农田的综合效益。
5. 推进农业机械化。加快农业机械化进程，提高农田的耕作效率，减少人工劳动，降低生产成本，提高农田利用效率。
6. 加强农田保护与修复。加强农田的保护管理，防止农田退化和水土流失等问题的发生，通过农田修复，恢复农田的肥力和生产能力。
7. 支持农田流转和规模经营。加大对农田流转和规模经营的政策支持力度，鼓励农民将零散的小块农田整合成较大的经营单元，提高农田的集约化经营水平。
8. 强化农田管理和监管。加强对农田的管理和监管，建立健全的农田管理制度和监测体系，推动农田利用的科学化、规范化和可持续发展。